Le Schéma d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE) constitue la stratégie locale et collective d'aménagement et de gestion équilibrée de la ressource en eau à l'échelle du bassin versant de la baie de Bourgneuf.   L'Observatoire de l'eau du bassin de la baie de Bourgneuf est basé sur les réseaux de suivi de la qualité des eaux existants.   Natura 2000 est un réseau écologique européen dont font partie le Marais breton et la Baie de Bourgneuf. Il est destiné à préserver les espèces et habitats rares ou menacés.